为配合大气污染防治行动计划落实，环保部正在酝酿与其配套的大气污染防治科技行动计划，该计划将通过专项资金支持与大气污染防治有关的科技攻关项目。
与大气污染防治有关的脱硫脱硝技术提升、机动车尾气、细颗粒物处理、污染源解析和大气污染预报预警等相关技术，都在该科技行动计划支持之列。其中，与VOC(挥发性有机物)有关的大气污染防治技术，以及细颗粒物处理的有关技术，将成为行动计划支持的重点之一。目前环保部已成立由多个部门和单位参与的专家组，今后企业、科研院所和高校都可申请该行动计划的有关专项资金。
业内人士认为，该行动计划出台，将成为继《蓝天科技工程“十二五”专项规划》后，又一个专门用于支持大气污染防治的科技专项政策。2012年10月，科技部、环保部曾联合公布《蓝天科技工程“十二五”专项规划》，该规划提出，要多渠道、多层次筹集社会资金，增加投入实施蓝天科技工程重点专项，积极利用金融及资本市场，将科技风险投资引入节能环保领域，开展专业化企业贷款风险补偿、技术研发后补助、高技术企业股权质押贷款等试点工作。并为10个左右重点区域和大中型城市大气污染防治提供技术方案与示范实践。